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Oct

31

BICCN勉強会

BICCNの論文をみんなで一気に輪読する会

Hashtag :#biccnjp
Registration info

参加者(発表者も含む)

Free

FCFS
406/410

参加者への情報
(参加者と発表者のみに公開されます)

Description

スライド・録画ファイルの共有について

  • 参加登録したIDでログインをすると、「参加者への情報」欄が表示されます。
  • そこに、スライド・録画ファイルへのリンクが書いてあります。
  • 他の人にリンクを教えたり、ファイルを共有しないようお願いいたします。

Zoom に入れない方へ

  • 14:19 Zoom の新しいURLを発行いたしました。アクセスし直しをお願いいたします!
  • 13:51 Zoom を立て直しました。同じURLでアクセスをお願いいたします。
  • 13:38 Zoom には入れない方がいらっしゃるとの報告を受けています。現在、管理者の方で確認しております。大変申し訳ございませんが、今しばらくお待ちいただければと思います。

参加方法

  • 参加登録したIDでログインをすると、「参加者への情報」欄が表示されます。
    • そこに Zoom のリンクと Slack 招待リンクが載っています。
  • 試聴だけなら Zoom で。
  • 実況・質問を楽しみたい方は Zoom + Slack で。

BICCN勉強会って?

2021年10月6日、米国NIHの Brain Research through Advancing Innovative Neurotechnologies (BRAIN) Initiative が Cell Census Network、通称 BICCN が公開されました。このBICCNについてNature誌において特集号が組まれ、実に18本の論文が掲載されました。さらに、Nature姉妹誌に掲載された論文も含めた Collection としても特設ページが公開されています。

これらの論文を解読・評価するには神経科学やゲノム科学など複数分野の専門家が必要です。そこで我々は、分野を融合した論文勉強会を企画しました。メインの論文紹介者が自分の専門分野の知見に基づいて担当論文を紹介し、それと相補的な関連分野の研究者がサブの紹介者として補足コメントを加えることで、対象論文の新規性や意義を多面的に理解することを目指します。

概要

  • 日時:2021年10月31日 [日] 13:00〜18:00
  • 場所:
    • 視聴:Zoom(参加登録をするとこのページに表示されます)
    • 実況・質問: Slack Discord (文字ベースのチャットサービス)
    • 視聴だけならZoomで、実況や質問を書き込みたい場合はDiscordを一緒に。

発表形式(発表者向け)

  • 1つの論文につき、メイン(発表者、ボケ)とサブ(コメンテーター、ツッコミ)がつきます。
    • メインの人は、事前に論文を読み、発表資料を作成し、当日発表します。
    • サブの人も、事前に論文を読み、メインの人が知らなそうな部分のみについて補足資料を準備し、メインの人の発表を補完するコメントをします。
  • メインがゲノム系の人の時は、サブを神経科学系の人が務めて議論を補完します。その逆も然り。
  • 発表時間
    • メインの発表:10分
    • サブのコメント:5分

質問・実況形式(視聴者向け)

  • 視聴者からの実況・質問は Slack に書き込んでいただきます。
  • これにメイン・サブの人が Zoom/Slack 上で返答します。

タイムスケジュール

開始時刻 終了時刻 内容 発表者
13:00 13:03 オープニング
13:03 13:18 1. A multimodal cell census and atlas of the mammalian primary motor cortex YUGI, Katsuyuki
13:18 13:33 2. A transcriptomic and epigenomic cell atlas of the mouse primary motor cortex Kotaro-Sekine
13:33 13:48 3. Comparative cellular analysis of motor cortex in human, marmoset and mouse YasuhiroGo
13:48 13:53 休憩
13:53 14:08 4. DNA methylation atlas of the mouse brain at single-cell resolution Yh_Taguchi
14:08 14:23 5. An atlas of gene regulatory elements in adult mouse cerebrum fukunagaTsu
14:23 14:38 6. Spatially resolved cell atlas of the mouse primary motor cortex by MERFISH tiisaishima
14:38 14:43 休憩
14:43 14:58 7. Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortex hirotakanagai
14:58 15:13 8. Human neocortical expansion involves glutamatergic neuron diversification Akiko Hayashi
15:13 15:28 9. Cellular anatomy of the mouse primary motor cortex Xiang Nie
15:28 15:33 休憩
15:33 15:48 10. Epigenomic diversity of cortical projection neurons in the mouse brain 小野口
15:48 16:03 11. Morphological diversity of single neurons in molecularly defined cell types Kenta Hagihara
16:03 16:18 12. Genetic dissection of the glutamatergic neuron system in cerebral cortex Takeshi Imai
16:18 16:23 休憩
16:23 16:38 13. The mouse cortico–basal ganglia–thalamic network TAKATA, Norio
16:38 16:53 14. Isoform cell-type specificity in the mouse primary motor cortex gggtta
16:53 17:08 15. An atlas of cortical arealization identifies dynamic molecular signatures MitsuruIshikawa
17:08 17:13 休憩
17:13 17:28 16. Single-cell epigenomics reveals mechanisms of human cortical development edamame0811
17:28 17:43 17. A transcriptomic atlas of mouse cerebellar cortex comprehensively defines cell types takaho tsuchiya ​​
17:43 17:58 18. Molecular logic of cellular diversification in the mouse cerebral cortex yuifu
17:58 18:01 エンディング

参加登録の方法

  • こちらの conpass の右の方から参加登録をお願いいたします。
  • 参加費:無料
  • 参加者も発表者も同じカテゴリで登録をお願いいたします。
  • どなたでも自由に参加いただけます(学生・社会人、アカデミア・企業、分野など特に制限はございません)。

発表者募集

  • 発表希望の方は、参加登録の上、コメント欄でどの論文を読むかを書き込んでください。
  • その際、ご自身の専門やバックグラウンドについて、「ゲノム・バイオインフォ」「神経科学」「それ以外(自由記述)」のいずれかの記入をお願いします。
  • 10月24日 [日] まで募集します。

録画について

  • 当日は録画し、事前登録者に限り 後日閲覧できるようにする予定です。
  • そのため、都合が間が合わないという場合にも参加登録をお願いいたします。

世話人

  • 尾崎遼(筑波大学)
  • 柚木克之(理化学研究所)
  • 福永津嵩(早稲田大学)

  • 問い合わせ: harukao.cb [at] gmail.com

補足

Feed

YUGI, Katsuyuki

YUGI, Katsuyuki wrote a comment.

2021/11/01 11:09

BICCN勉強会の模様を録画した動画ファイルの置き場をconnpassページに公開しました。

YUGI, Katsuyuki

YUGI, Katsuyuki wrote a comment.

2021/10/31 14:38

ライセンス数を500人分確保しましたが、200人までしか入れないトラブルが発生しております。新しいzoom URLをconnpassページに公開しましたのでお手数ですが再度お試しいただければ幸いです。

kmdqcom

kmdqcom wrote a comment.

2021/10/31 14:15

再度zoomに入り直そうとしたら、「このミーティングの参加者は最大数の 200 人に達しました。後でもう一度やり直してください。」 と出ます。

akikotakagi3

akikotakagi3さんが資料をアップしました。

10/30/2021 21:54

fukunagaTsu

fukunagaTsu wrote a comment.

2021/10/26 16:34

10. Epigenomic diversity of cortical projection neurons in the mouse brainに関しまして、早大浜田研の小野口さんが発表してくださるとのことですので、私からお譲りいたします。

tiisaishima

tiisaishima wrote a comment.

2021/10/23 07:45

6. Spatially resolved cell atlas of the mouse primary motor cortex by MERFISHの発表について、記述を忘れてしまっていたのですが、専門はバイオインフォです。どうぞよろしくお願いいたします。

takata_norio

takata_norio wrote a comment.

2021/10/22 17:40

“13. The mouse cortico–basal ganglia–thalamic network”の発表を希望します。専門は神経科学です。

fukunagaTsu

fukunagaTsu wrote a comment.

2021/10/22 14:15

二本目ですが、10. Epigenomic diversity of cortical projection neurons in the mouse brain を引き受けます。専門はバイオインフォ です。(発表希望の方がいらっしゃればお譲りします。)

xnie

xnie wrote a comment.

2021/10/21 13:20

神経科学でダブらないように「9. Cellular anatomy of the mouse primary motor cortex」に変更します。宜しくおねがいします。

YUGI, Katsuyuki

YUGI, Katsuyuki wrote a comment.

2021/10/21 13:16

九州大学・今井先生の代理投稿です。(神経科学バックグラウンド) 12. Genetic dissection of the glutamatergic neuron system in cerebral cortex

xnie

xnie wrote a comment.

2021/10/21 13:11

12. Genetic dissection of the glutamatergic neuron system in cerebral cortexの発表を希望します。専門は神経科学です。

takaho tsuchiya

takaho tsuchiya wrote a comment.

2021/10/21 12:55

17. A transcriptomic atlas of mouse cerebellar cortex comprehensively defines cell types の発表を希望します。専門はバイオバイオインフォマティクスです。

YUGI, Katsuyuki

YUGI, Katsuyuki wrote a comment.

2021/10/20 14:36

論文の空き状況は以下の google document に一覧表があります。 https://docs.google.com/document/d/1vKkX5NgvtRgYkdEVtfZUwtlV6XTyQB4feobCapN51oA/edit#heading=h.n60motyhbguj

YUGI, Katsuyuki

YUGI, Katsuyuki wrote a comment.

2021/10/20 12:31

論文の空き状況は以下の google document に一覧表があります。 https://docs.google.com/document/d/1WKCxOjBG_AyJGqwzavAEpNwRB5Hg4sYLiUZMnzSO8Po/edit?usp=sharing

yuifu

yuifu wrote a comment.

2021/10/20 10:38

18. Molecular logic of cellular diversification in the mouse cerebral cortex​​ を担当します! 専門はバイオインフォマティクスです

yuifu

yuifu wrote a comment.

2021/10/20 10:37

>石川さん  15、よろしくお願いいたします!

MitsuruIshikawa

MitsuruIshikawa wrote a comment.

2021/10/20 09:24

石川充(岡野研)です。15. An atlas of cortical arealization identifies dynamic molecular signaturesの内容を紹介させていただけますでしょうか?(専門はヒトiPS細胞で領域はどっちともつかず微妙なのですが、サブとしてどなたか神経科学の観点で突っ込んでもらえたらと思います。)

YUGI, Katsuyuki

YUGI, Katsuyuki wrote a comment.

2021/10/19 18:15

私自身は "1. A multimodal cell census and atlas of the mammalian primary motor cortex" の内容を紹介します。

YUGI, Katsuyuki

YUGI, Katsuyuki wrote a comment.

2021/10/19 18:12

林さんの代理投稿です。8. Human neocortical expansion involves glutamatergic neuron diversification を発表します。

hirotakanagai

hirotakanagai wrote a comment.

2021/10/19 09:11

7. Phenotypic variation of transcriptomic cell types in mouse motor cortexの発表を希望します。専門は神経科学です。

Kotaro-Sekine

Kotaro-Sekine wrote a comment.

2021/10/18 21:36

2. A transcriptomic and epigenomic cell atlas of the mouse primary motor cortexの発表を希望します.専門はバイオインフォマティクスです.

tiisaishima

tiisaishima wrote a comment.

2021/10/13 13:22

6. Spatially resolved cell atlas of the mouse primary motor cortex by MERFISHの発表を希望します。

Kenta Hagihara

Kenta Hagihara wrote a comment.

2021/10/12 08:14

神経科学ポッドキャストを主催しており、最新回でBICCN特集を組んでいます。ざっくりと各論文の内容を雑談する内容になっているため(手前味噌ですが)今回の輪読会のpreview的に聴いてもらえると見通しをつけるのに多少役にたつかもしれません。http://neuroradio.tokyo/2021/10/12/27-a-rosetta-stone-for-neuroscience/ (宣伝、不適切でしたら削除してください)

Kenta Hagihara

Kenta Hagihara wrote a comment.

2021/10/12 07:46

11.Morphological diversity of single neurons in molecularly defined cell types の発表を希望します。専門はシステム寄りの神経科学です。

gggtta

gggtta wrote a comment.

2021/10/11 14:30

14.Isoform cell-type specificity in the mouse primary motor cortexの発表を希望します。

edamame0811

edamame0811 wrote a comment.

2021/10/11 14:05

16. Single-cell epigenomics reveals mechanisms of human cortical development の発表を希望します。

fukunagaTsu

fukunagaTsu wrote a comment.

2021/10/11 13:40

5. An atlas of gene regulatory elements in adult mouse cerebrumの発表をできればと思います

YasuhiroGo

YasuhiroGo wrote a comment.

2021/10/11 13:27

"3. Comparative cellular analysis of motor cortex in human, marmoset and mouse" のメイン(ボケ)希望します

Yh_Taguchi

Yh_Taguchi wrote a comment.

2021/10/11 13:13

DNA methylation atlas of the mouse brain at single-cell resolutionをやりますが、他にもっと適当な人がいたら譲りますのでご連絡ください。

yuifu

yuifu published BICCN勉強会.

10/11/2021 12:59

BICCN勉強会 has been published!

Ended

2021/10/31(Sun)

13:00
18:00

You cannot RSVP if you are already participating in another event at the same date.

Registration Period
2021/10/11(Mon) 12:58 〜
2021/10/31(Sun) 18:00

Location

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yuifu

yuifu

I joined BICCN勉強会!

Yh_Taguchi

Yh_Taguchi

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fronori

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Masanori Kawabata

Masanori Kawabata

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YasuhiroGo

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takumatanaka

takumatanaka

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Kei

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FuminoFujiyama

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MitsuruIshikawa

MitsuruIshikawa

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fukunagaTsu

fukunagaTsu

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